结论：可以，但严格来说不叫"亲子鉴定"，而叫"亲缘鉴定"。

一个真实案例

一个月前，上海崇明县25岁的李晋因车祸去世，留下1岁的儿子翔翔和年轻的妻子。妻子明确表示不愿抚养孩子，一直无子女的堂哥李晋提出愿意收养翔翔。

然而男方家人突然想起，李晋生前曾多次怀疑孩子并非亲生。如果到头来帮别人养了孩子，后果不堪设想。可此时李晋遗体已火化，无法提取DNA做常规亲子鉴定。

李晋的父母随即向DNA鉴定中心咨询：爷爷奶奶能不能和孙子做亲子鉴定？

为什么常规亲子鉴定行不通？

常规亲子鉴定的原理很明确：孩子一半遗传物质来自父亲，一半来自母亲。通过比对特定位点的DNA指纹，就能判断孩子与父亲是否有血缘关系。

但李晋已去世，鉴定人员无法获取他的遗传物质进行直接比对，常规路径走不通。

隔代鉴定的科学依据：Y染色体

虽然父亲不在了，但遗传学提供了另一条路径。

决定男性性别的Y染色体，只能由父亲传给儿子。爷爷将自己的Y染色体传给李晋，李晋再将同一条Y染色体传给翔翔。因此，祖孙三代男性的Y染色体是完全相同的。

利用这一规律，鉴定人员可以提取爷爷的DNA，与翔翔的Y染色体进行比对。虽然不能像父子鉴定那样给出确定性结论，但足以帮助家属排除翔翔是否为李晋亲生。

5个工作日后，结果出炉：翔翔的Y染色体与爷爷不匹配，证实他不是李晋的亲生儿子。

关键限制：只适用于男性后代

这里必须说清一个重要前提：

Y染色体只存在于男性体内，且只在父系中传递。所以：

爷爷与孙子：可以做Y染色体亲缘鉴定，结果具有较高参考价值。

爷爷与孙女：无法直接通过Y染色体鉴定，因为孙女没有Y染色体。若要鉴定，需尽可能多地找到孙女的近血亲（如叔叔、姑姑等），通过综合比对计算亲缘概率，但报告只能给出概率值，无法给出确定性结论。

总结

所谓"隔代亲子鉴定"，正规名称应为亲缘鉴定，亲子鉴定仅限于父母与子女之间。隔代鉴定的核心手段是Y染色体比对，适用于爷爷与孙子之间，能够有效排除或支持血缘关系。但对孙女则需借助多位近亲综合分析，且结论以概率形式呈现。

回到这个案例，正因为做了这次隔代鉴定，男方家人才及时避免了替他人养孩子的风险。